从一之岛前往二之岛的核心方式是乘坐圣安奴号游轮。玩家需先在一之岛完成主线任务，包括修复机器和获取红宝石的剧情。完成后，返回一之岛的码头与水手对话，选择二之岛作为目的地即可启程。圣安奴号是连接关都地区与七岛群岛的主要交通工具，航行路线固定且无需额外条件触发。

若玩家已完成七岛主线剧情，需先满足特定条件才能重新解锁航线。需捕获至少60种不同的宝可梦并找大木博士升级图鉴，之后在枯叶市码头或一之岛码头与船员对话领取彩虹通行证。该通行证允许玩家自由往返所有已解锁的岛屿，包括二之岛。此机制旨在鼓励玩家探索图鉴收集玩法。

二之岛的地理位置位于一之岛西南方向，游戏内航行过程为黑屏加载，无实际海上移动动画。抵达后，玩家会出现在二之岛南部的码头区域。该岛主要区域包括欢乐游戏厅、歧波海湾及树果森林，其中欢乐游戏厅可触发寻找失踪女孩的支线任务，该任务后续需前往三之岛完成。

在二之岛的歧波海湾，玩家可通过冲浪技能探索隐藏道具，包括PP最大剂和神奇糖果。树果森林则分布着16种不同属性的树果，需使用居合斩清除障碍物进入。二之岛没有道馆设施，其主要功能是推进七岛剧情和提供稀有资源收集点。

若玩家使用特定改版游戏如宝可梦无限融合，需采用潜水技能绕行岩石障碍。该操作需先在一之岛右侧海域潜水，避开地图障碍后上浮至破船附近，再向北冲浪抵达二之岛。此路线为改版特有机制，原版火红不存在此设计。

最后需注意，二之岛与后续岛屿的剧情存在关联。完成二之岛任务后，系统会提示前往三之岛继续主线。游戏内航行功能始终保持线性推进，玩家无法跳过剧情直接访问未解锁岛屿。这种设计确保了游戏叙事的连贯性和探索的阶段性。